1. В каком из перечисленных методов используются обратная транскриптаза и РНК-полимераза?
1) транскрипционная амплификация; +
2) ПЦР в реальном времени;
3) выделение ДНК;
4) гель-электрофорез;
5) мультиплексная ПЦР.
2. В процессе ПЦР синтез праймеров
1) не осуществляется, праймеры добавляются до начала реакции; +
2) не осуществляется, праймеры необходимы только для репликации ДНК in vivo;
3) осуществляется ДНК-полимеразой;
4) осуществляется совместным действием ДНК-полимеразы и праймазы;
5) осуществляется ферментом праймазой.
3. В ПЦР могут синтезироваться и неспецифические продукты реакции, обычно низкой молекулярной массы (30-50 пар нуклеотидов). Что они обычно представляют собой?
1) димеры праймеров; +
2) Alu-повторы;
3) ДНК-транспозоны;
4) свободные промоторы.
4. В реакционной смеси для ПЦР находится 1000 копий амплифицируемых участков ДНК. Какое количество копий будет в реакционной смеси через 3 цикла в случае идеальной ПЦР?
1) 8000; +
2) 1000;
3) 10000;
4) 5000;
5) 700.
5. В чем будет состоять основное отличие системы для ПЦР-диагностики Legionella pneumophila от системы для ПЦР-диагностики Mycobacterium tuberculosis?
1) в последовательностях праймеров; +
2) в используемых красителях;
3) в используемых ферментах;
4) в наборе питательных сред;
5) в структуре нуклеозидтрифосфатов.
6. В чём назначение гасителей, входящих в состав молекулярных зондов?
1) они предотвращают флуоресценцию флуорофора; +
2) они запускают разрушение зонда;
3) они ингибируют активность ДНК-полимеразы;
4) они предотвращают присоединение зонда к ДНК;
5) они служат затравкой для синтеза ДНК.
7. Дана последовательность ДНК 5'-CGGAT-3'. Какая из указанных последовательностей будет комплементарной к ней?
1) 5'-ATCCG-3'; +
2) 5'-AAATT-3';
3) 5'-CAGAT-3';
4) 5'-CGCAT-3';
5) 5'-TAGCT-3'.
8. Для каких молекул, используемых в методах амплификации нуклеиновых кислот, характерно наличие внутреннего самокомплементарного участка?
1) молекулярные "маячки"; +
2) РНКазы;
3) интеркалирующие красители;
4) линейные разрушаемые зонды;
5) праймеры.
9. Для чего при проведении ПЦР может использоваться обратная транскриптаза?
1) для обнаружения специфических молекул РНК; +
2) для денатурации ДНК;
3) для разделения ДНК по массе;
4) для разрушения праймеров.
10. Интеркалирующие красители обычно представляют собой
1) положительно заряженные плоские молекулы, способные вставляться в стопку азотистых оснований; +
2) белки, приобретающие способность светиться при окислении кислородом воздуха;
3) комплексные соединения из ионов металлов и органического хелатирующего агента;
4) комплексы из флуорофора и гасителя.
11. Как называется специфический участок ДНК, на котором происходит инициация синтеза РНК ферментом РНК-полимеразой?
1) промотор; +
2) оператор;
3) оперон;
4) праймер;
5) терминатор.
12. Какая особенность молекулярных "маячков" позволяет им не флуоресцировать в растворе, но флуоресцировать при связывании с целевой последовательностью?
1) они образуют шпилечную структуру с флуорофором и гасителем на разных концах, которая раскрывается при комплементарном связывании с мишенью; +
2) они распадаются на отдельные нуклеотиды за счет внутренней рибозимной активности, в результате чего гаситель необратимо разрушается;
3) они служат матрицей для синтеза флуоресцентных продуктов ДНК-полимеразой.
13. Какие компоненты обязательно должны присутствовать в реакционной смеси для ПЦР?
1) ДНК-полимераза; +
2) дезоксинуклеозидтрифосфаты; +
3) праймеры; +
4) РНК-полимераза;
5) агароза.
14. Какие полимеры используют для изготовления гелей для гель-электрофореза ДНК?
1) агароза; +
2) полиакриламид; +
3) гиалуроновая кислота;
4) полиэтиленгликоль.
15. Какова функция дезоксинуклеозидтрифосфатов в реакционной смеси для ПЦР?
1) они являются строительными блоками (мономерами) для синтеза ДНК; +
2) они выступают в качестве кофакторов для РНК-полимеразы;
3) они обеспечивают раскрывание молекулярных "маячков";
4) они стабилизируют ДНК-матрицу при высоких температурах.
16. Какое ключевое событие происходит в ПЦР на стадии элонгации?
1) достройка комплементарной цепи ДНК с помощью ДНК-полимеразы; +
2) присоединение праймера к комплементарному участку ДНК;
3) разделение двухцепочечных молекул ДНК по массе;
4) разделение цепей ДНК под действием температуры;
5) разрушение ДНК-полимеразы.
17. Какое утверждение корректно описывает ограничение ПЦР как метода диагностики инфекционных заболеваний?
1) ПЦР не позволяет отличить ДНК живого, жизнеспособного микроорганизма от ДНК мертвых клеток или свободных фрагментов ДНК; +
2) ПЦР дает результат только через несколько суток, что не подходит для срочной диагностики;
3) ПЦР обладает низкой чувствительностью и не может обнаружить единичные копии ДНК;
4) ПЦР требует очень большого количества биологического материала для анализа.
18. Какой способностью должен обладать амплификатор для проведения ПЦР?
1) изменять температуру реакционной смеси по заданной программе; +
2) заменять реакционный буфер после каждого цикла;
3) ионизировать молекулы нуклеиновых кислот;
4) производить детекцию бактериальных и вирусных белков;
5) производить электропорацию бактериальных клеток.
19. Какой способностью должен обладать амплификатор для проведения ПЦР в реальном времени?
1) измерять флуоресценцию реакционной смеси; +
2) измерять электропроводность реакционной смеси;
3) проводить капиллярный электрофорез;
4) проводить лазерную десорбцию ДНК;
5) фрагментировать ДНК ультразвуком.
20. Какую длину последовательности ДНК можно прочитать с помощью ПЦР?
1) ПЦР не является методом прочтения молекул ДНК, а только методом их амплификации; +
2) 10 пар нуклеотидов;
3) 100 пар нуклеотидов;
4) 1000 пар нуклеотидов;
5) длина прочтенной последовательности будет определяться количеством циклов ПЦР.
21. Какую из перечисленных реакций можно проводить при постоянной температуре?
1) транскрипционная амплификация; +
2) ПЦР в реальном времени;
3) ПЦР с обратной транскрипцией;
4) конвенциональная ПЦР;
5) мультиплексная ПЦР.
22. Какую реакцию катализирует фермент РНКаза H?
1) расщепляет РНК в двойной спирали РНК-ДНК; +
2) разделяет цепи в двойной спирали ДНК;
3) расщепляет обе цепи в двойной спирали РНК;
4) синтезирует праймеры;
5) синтезирует цепь ДНК по матрице цепи РНК.
23. Какую реакцию способна катализировать обратная транскриптаза?
1) синтеза ДНК на матрице РНК; +
2) синтеза РНК на матрице ДНК;
3) синтеза РНК на матрице белка;
4) синтеза белка на матрице РНК;
5) синтеза случайных последовательностей ДНК.
24. Короткие фрагменты ДНК, которые комплементарны участкам ДНК из противоположных цепей, находящимся на концах последовательности-мишени, называются
1) праймерами; +
2) векторами;
3) маркерами;
4) молекулярными зондами;
5) промоторами.
25. Наличие каких химических групп придает молекулам ДНК отрицательный заряд в водных растворах при физиологических значениях pH?
1) остатков фосфорной кислоты; +
2) гидроксильных групп дезоксирибозы;
3) карбоксильных групп аспарагиновой кислоты;
4) карбоксильных групп глутаминовой кислоты;
5) тиоэфирных связей.
26. Наличие какой ферментативной активности ДНК-полимеразы необходимо для использования линейно разрушаемых зондов?
1) 5'-3'-экзонуклеазной; +
2) ДНК-лигазной;
3) РНК-полимеразной;
4) протеазной;
5) хеликазной.
27. Основным требованием, которое предъявляется к используемым в ПЦР ДНК-полимеразам, является
1) термостабильность; +
2) ДНК-лигазная активность;
3) буферные свойства;
4) кислотоустойчивость;
5) эндонуклеазная активность.
28. Помимо синтеза ДНК на матрице РНК, некоторые обратные транскриптазы также обладают специфической активностью, которая помогает в удалении исходной РНК-матрицы из гибрида РНК-ДНК. Как называется эта активность?
1) активность РНКазы H; +
2) ДНК-лигазная активность;
3) РНК-полимеразная активность;
4) активность ДНК-гиразы.
29. После проведенного курса антибиотикотерапии урогенитального хламидиоза через три дня был взят анализ на выявление Chlamydia trachomatis с помощью ПЦР. Результат анализа оказался положительным. Свидетельствует ли это о неэффективности терапии?
1) нет, так как ДНК способна длительно сохраняться после элиминации возбудителя; +
2) да, так как это означает наличие живого возбудителя;
3) нет, так как ПЦР не может быть использован для выявления возбудителей инфекций, передающихся половым путём;
4) нет, так как ПЦР не может быть использован для выявления хламидий;
5) нет, так как антимикробные препараты в биологическом материале могут приводить к ложноположительным результатам.
30. Почему конвенциональная ПЦР (без детекции в реальном времени) обычно не подходит для точного количественного определения исходного количества ДНК-матрицы?
1) реакция достигает фазы плато, где накопление продукта перестает быть пропорциональным начальному количеству матрицы; +
2) наличие РНК-полимеразы вносит помехи в количественное определение ДНК;
3) она не может различать ДНК- и РНК- матрицы;
4) она производит слишком много неспецифических продуктов.
31. Почему ПЦР в реальном времени представляет меньшую угрозу контаминации по сравнению с ПЦР с детекций при помощи гель-электрофореза?
1) отсутствует необходимость открывать пробирки после амплификации; +
2) ДНК-зонды не способны присоединяться к контаминирующей ДНК;
3) интеркалирующие красители разрушают постороннюю ДНК;
4) при ПЦР в реальном времени мишенью для амплификации может служить только РНК;
5) при ПЦР в реальном врмени не происходит амплификации ДНК.
32. Праймеры, применяемые в ПЦР - это
1) короткие одноцепочечные молекулы ДНК; +
2) длинные двухцепочечные молекулы ДНК;
3) нуклеозидтрифосфаты;
4) радиоактивные или биотиновые метки;
5) термостабильные ферменты.
33. Преимуществами методов амплификации нуклеиновых кислот в реальном времени по сравнению с использованием электрофоретической детекции являются
1) возможность определения количества специфического участка нуклеиновой кислоты в образце; +
2) исключение риска контаминации последующих образцов продуктами амплификации; +
3) уменьшение времени до получения результата; +
4) возможность выявления не только тех возбудителей, которые изначально предполагались;
5) возможность обнаружения возбудителей вирусных инфекционных заболеваний.
34. Промотор представляет собой
1) точку начала синтеза РНК ферментом РНК-полимеразой; +
2) олигонуклеотиды, который имеет внутри себя самокомплементарный участок;
3) точку начала репликации ДНК ферментом ДНК-полимеразой;
4) точку начала синтеза белка рибосомой.
35. С какой целью при гель-электрофорезе применяется бромистый этидий?
1) он образует флуоресцентные комплексы с молекулами ДНК; +
2) он обеспечивает разную подвижность двойных спиралей ДНК в зависимости от размера;
3) он способствует денатурации двойных спиралей ДНК;
4) он формирует структуру геля;
5) от придает отрицательный заряд молекулам ДНК.
36. С помощью какого из перечисленных методов возможно определить молекулярную массу молекул ДНК, полученных в результате ПЦР?
1) гель-электрофорез; +
2) диско-диффузионный метод;
3) обратная транскрипция;
4) транскрипционная амплификация;
5) электропорация.
37. С помощью чего в полимеразной цепной реакции происходит разделение цепей ДНК?
1) температуры; +
2) РНК-полимеразы;
3) РНКазы H;
4) бромистого этидия;
5) топоизомеразы.
38. Сорбция молекул ДНК на колонке из диоксида кремния может использоваться в процессе
1) выделения ДНК; +
2) гель-электрофореза;
3) денатурации;
4) отжига праймеров;
5) элонгации.
39. Чем будет определяться длина продуктов ПЦР?
1) расстоянием между местами отжига праймеров в исходной ДНК; +
2) количеством циклов ПЦР;
3) концентрацией исходных молекул ДНК;
4) концентрациями нуклеозидтрифосфатов;
5) температурой, при которой происходит денатурация.
40. Чем осуществляется разрушение линейных разрушаемых зондов при ПЦР в реальном времени?
1) 5'-3'-экзонуклеазной активностью ДНК полимеразы; +
2) 3'-5'-экзонуклеазной активностью РНК-полимеразы;
3) активностью эндонуклеаз рестрикции;
4) высокой температурой.
41. Чем полимеразы для ПЦР с "горячим" стартом отличаются от классических?
1) их ферментативная активность заблокирована при низких температурах для предотвращения образования неспецифичных продуктов; +
2) они имеют "вытесняющую" активность, что позволяет обходиться без стадии денатурации;
3) они могут использовать в качестве праймера пептид Vpg;
4) они со схожей эффективностью присоединяют дезокси- и дидезокси-нуклеозидтрифосфаты.
42. Что должно присутствовать в реакционной смеси для постановки мультиплексной ПЦР в реальном времени?
1) несколько зондов, способных связываться с получающимися продуктами реакции и содержащих разные флуорофоры; +
2) РНК-полимераза и обратная транскриптаза;
3) гуанидина тиоцианат и диоксид кремния;
4) несколько различных интеркалирующих красителей;
5) смесь различных РНКаз.
43. Что должно происходить в идеальном случае за один цикл ПЦР?
1) удвоение концентрации продукта реакции; +
2) высвобождение большого количества квантов света;
3) объединение нескольких олигонуклеотидов в одну цепь;
4) присоединение одного или нескольких нуклеотидов;
5) разрушение половины молекул ДНК-полимеразы.
44. Что обычно происходит в реакционной смеси при ПЦР после 20-30 циклов?
1) количество ПЦР-продукта выходит на плато из-за накопления продукта ПЦР, снижения концентрации праймеров и также накопления пирофосфата; +
2) количество ПЦР-продукта нарастает до такой степени, что в образце формируется гель из молекул ДНК;
3) количество ПЦР-продукта начинает уменьшаться из-за вызванного нагревом разрушения, и к 40 циклам ДНК в образце исчезает.
45. Что является основным отличием ПЦР в реальном времени от ПЦР с электрофоретической детекцией?
1) определение концентрации продукта ПЦР непосредственно в ходе реакции; +
2) добавление новой порции ДНК-полимеразы после каждого цикла;
3) использование РНК-полимеразы для синтеза новых цепей РНК;
4) использование более длинных праймеров, комплементарных концам целевого продукта реакции;
5) отсутствие стадии денатурации за счет использования специальных ферментов.