1. В синтезе каких веществ, имеющих биологическую активность в организме человека, принимают участие бактерии нормальной микробиоты?
1) вторичные желчные кислоты; +
2) короткоцепочечные жирные кислоты; +
3) липополисахарид; +
4) первичные желчные кислоты.
2. Выберите верные утверждения
1) на состав микробиоты влияют множество факторов: заболевания, особенности диеты, прием лекарств; +
2) набор видов бактерий, обнаруживаемых в микробиоте толстого кишечника, отличается у разных людей; +
3) состав микробиоты человека в большей степени объясняется факторами окружающей среды и совместным проживанием, чем наследственностью; +
4) большую часть микробиоты толстого кишечника взрослого человека составляют бифидобактерии и лактобациллы;
5) большую часть микробиоты толстого кишечника взрослого человека составляют эшерихии.
3. Высокое содержание Bifidobacterium характерно для кишечной микробиоты
1) грудных детей до введения прикорма; +
2) людей с антибиотик-ассоциированной диареей;
3) людей с целиакией.
4. Для микробиоты толстого кишечника грудных детей характерна высокая численность представителей рода
1) Bifidobacterium; +
2) Bordetella;
3) Mycobacterium;
4) Treponema;
5) Yersinia.
5. Достоинствами культивирования как метода исследования микробиоты человека являются
1) возможность определять абсолютные численности микроорганизмов; +
2) возможность получать чистые культуры микроорганизмов; +
3) возможность оценить генетическое разнообразие представителей микробиоты;
4) возможность получить представления о полном разнообразии доминирующих групп микроорганизмов.
6. Какая из перечисленных технологий лежит в основе метагеномных исследований?
1) Next generation sequencing (NGS); +
2) MALDI-ToF масс-спектрометрия;
3) гель-электрофорез;
4) полимеразная цепная реакция в реальном времени;
5) электропорация.
7. Какие из перечисленных бактерий легко культивируются на питательных средах, но не являются доминирующей частью кишечной микробиоты?.
1) Lactobacillus; +
2) Blautia;
3) Faecalibacterium.
8. Какие из перечисленных веществ входят в понятие "короткоцепочечные жирные кислоты"?
1) ацетат; +
2) бутират; +
3) пропионат; +
4) дезоксихолат;
5) таурохолат.
9. Какие из перечисленных подходов позволяет изучить состав микробиоты кишечника с учетом не только доминирующих, но и редких видов?
1) культивирование на селективных средах; +
2) метагеномное секвенирование с высоким числом прочтений на образец; +
3) ПЦР с праймерами на IS-элементы;
4) темпнопольная микроскопия.
10. Какие из перечисленных утверждений описывают основные преимущества метагеномного подхода в изучении микробиоты человека?
1) возможность оценить генетическое разнообразие представителей микробиоты; +
2) возможность получить представления о полном разнообразии доминирующих групп микроорганизмов; +
3) возможность получать чистые культуры микроорганизмов;
4) низкая стоимость и трудоемкость.
11. Какие этапы обязательно включают в себя метагеномные исследования?
1) выделение ДНК из биологического образца; +
2) массовое параллельное секвенирование молекул ДНК; +
3) MALDI-ToF масс-спектрометрия;
4) выделение чистых культур бактерий.
12. Какими рецепторами осуществляется распознавание липополисахарида?
1) паттерн-распознающими рецепторами (TLR4); +
2) гистон-деацетилазами;
3) рецепторами глюкагон-подобного пептида (GLP1R);
4) рецепторами жирных кислот (FFAR1)
13. Каков основной результат секвенирования ДНК?
1) последовательность нуклеотидов; +
2) трехмерная структура молекулы ДНК;
3) уровень экспрессии определенного белка;
4) функция определенного гена.
14. Какова основная цель процесса секвенирования ДНК?
1) определение последовательности нуклеотидов в молекуле ДНК; +
2) идентификация специфических повреждений в структуре ДНК;
3) измерение молекулярной массы отдельных фрагментов ДНК;
4) определение пространственной конфигурации молекулы ДНК;
5) создание множественных копий определенных участков генома.
15. Какое из перечисленных веществ, способных производиться бактериями кишечной микробиоты, обладает канцерогенными свойствами за счёт способности алкилировать ДНК?
1) колибактин; +
2) ацетат;
3) липополисахарид;
4) пептидогликан.
16. Какой из перечисленных методов видовой идентификации бактерий является наиболее быстрым?
1) MALDI-ToF масс-спектрометрия; +
2) биохимическая идентификация по спектру ферментативной активности;
3) секвенирование и анализ полного генома;
4) секвенирование фрагмента гена 16S рРНК.
17. Какой из перечисленных подходов позволяет выявить в составе микробиоты кишечника микроорганизмы, которые не могут быть культивированы в лабораторных условиях?
1) метагеномное секвенирование; +
2) MALDI-ToF масс-спектрометрия;
3) использование микроанаэростатов;
4) микроскопия с окрашиванием по Граму.
18. Какой этап включают в себя исследования, проводимые в рамках подхода метатаксономики (метагеномного исследования гена 16S РНК)?
1) амплификация фрагмента секвенируемого гена; +
2) биохимическая идентификация чистых культур;
3) выделение чистых культур;
4) масс-спектрометрия;
5) электропорация.
19. Контиги представляют собой
1) непрерывные участки геномов, получаемые за счёт сборки отдельных прочтений; +
2) гены, наиболее консервативные среди бактерий;
3) полные бактериальные геномы;
4) спектры масс бактериальных белков.
20. Метагеномные исследования позволяют исследовать
1) состав микробной популяции в биологическом образце; +
2) изменение функционирования бактериальной клетки при смене условий;
3) набор метаболитов в составе бактериальной клетки;
4) реакцию клеток человека на активность микробиоты.
21. На каком принципе основан метод MALDI-ToF масс-спектрометрии для идентификации микроорганизмов?
1) определение масс-зарядового отношения ионов белков; +
2) анализ нуклеотидной последовательности;
3) измерение скорости миграции белков в геле;
4) измерение флуоресценции ДНК-связывающих красителей.
22. Наиболее точным методом видовой идентификации чистой культуры бактерий является
1) секвенирование гена 16S рРНК; +
2) ПЦР в реальном времени гена ДНК-гиразы;
3) гель-электрофорез ДНК-полимеразы;
4) определение массы бактериальной хромосомы;
5) определение числа копий гена 16S рРНК в хромосоме.
23. Основное назначение микроанаэростатов в микробиологии заключается в создании условий для
1) культивирования микроорганизмов в бескислородной атмосфере; +
2) биохимической идентификации бактерий;
3) выделения бактериальной ДНК;
4) стерилизации питательных сред.
24. По отношению к кислороду большинство представителей микробиоты толстого кишечника взрослого человека являются
1) облигатными анаэробами; +
2) аэротолерантными бактериями;
3) облигатными аэробами;
4) факультативными анаэробами.
25. Представители каких из перечисленных родов бактерий в часто встречаются в микробиоте толстого кишечника человека?
1) Alistipes; +
2) Bacteroides; +
3) Borrelia;
4) Mycobacterium;
5) Salmonella.
26. Представители каких из перечисленных родов бактерий в часто встречаются в микробиоте толстого кишечника человека?
1) Blautia; +
2) Faecalibacterium; +
3) Chlamydia;
4) Neisseria;
5) Yersinia.
27. Представители каких из перечисленных типов бактерий доминируют в микробиоте толстого кишечника взрослого человека?
1) Bacteroidetes (Bacteroidota); +
2) Firmicutes (Bacillota); +
3) Planctomycetes (Planctomycetota);
4) Thermotogae (Thermotogota).
28. Представители каких из перечисленных типов бактерий представлены в микробиоте толстого кишечника взрослого человека единичными процентами?
1) Actinobacteria (Actinomycetota); +
2) Proteobacteria (Pseudomonadota); +
3) Chlamydiae (Chlamydiota);
4) Cyanobacteria (Cyanobacteriota).
29. При проведении метагеномного исследования объектом высокопроизводительного секвенирования служит
1) тотальная ДНК, выделенная из образца сложного микробного сообщества; +
2) ДНК, выделенная из чистой культивированной колонии прокариот;
3) генетический материал индивидуального эукариотического организма;
4) матричная РНК, полученная от одного вида бактерий;
5) рибосомальная РНК чистой бактериальной культуры..
30. При сборке геномов из коротких секвенированных фрагментов, перекрывающиеся участки объединяются в непрерывные последовательности, называемые
1) контиги; +
2) спектры;
3) таксоны;
4) чистые культуры;
5) энтеротипы.
31. Развитие антибиотик-ассоциированной диареи часто связано с избыточным ростом в кишечнике бактерии
1) Clostridium difficile; +
2) Bacteroides ovatus;
3) Barnesiella intestinihominis;
4) Clostridium scindens;
5) Faecalibacterium prausnitzii.
32. С какой целью в основном применяется MALDI-ToF масс-спектрометрия в исследовании микробиоты толстого кишечника?
1) идентификация чистых культур бактерий по спектру масс белков; +
2) определение спектра масс белков в образце фекалий;
3) определение спектра масс нуклеиновых кислот, выделенных из образца фекалий;
4) подсчёт численности бактерий определенного вида в биологическом образце;
5) получение чистых культур бактерий за счёт механического разобщения.
33. Соберите контиг из двух прочтений ДНК: AAAGTGAGTG и TGAGTGCCCC
1) AAAGTGAGTGCCCC; +
2) CCCGATGCGATGCGAA;
3) GCTGATGCAAACGA;
4) TTCGATTGCGAT.
34. Технологии NGS используют для того, чтобы провести
1) параллельное секвенирование множества фрагментов ДНК; +
2) определение спектра масс белков в бактериальной клетке;
3) очистку ДНК от посторонних примесей;
4) параллельное культивирование множества бактериальных штаммов;
5) секвенирование одного длинного фрагмента ДНК.
35. Укажите механизмы колонизационной резистентности
1) конкуренция за питательные вещества; +
2) образование вторичных желчных кислот; +
3) продукция бактериоцинов; +
4) синтез пептидогликана.
36. Укажите молекулы, синтезируемые представителями микробиоты человека и распознаваемые паттерн-распознающими рецепторами человека (PRR)
1) липополисахарид; +
2) фрагменты пептидогликана; +
3) пептид YY;
4) первичные желчные кислоты;
5) уксусная кислота.
37. Энетротипы представляют собой
1) часто встречающиеся варианты микробиоты толстого кишечника, характеризующиеся преобладанием различных групп бактерий; +
2) внутривидовые группы бактерий, характерные для микробиоты толстого кишечника;
3) методы видовой идентификации микроорганизмов нормальной микробиоты толстого кишечника;
4) типы бактерий, к которым относятся численно доминирующие представители нормальной микробиоты толстого кишечника человека (т.е. Firmicutes, Bacteroides).