1. Амплификация ДНК представляет собой
1) многократное копирование определенного участка ДНК; +
2) анализ повреждений молекулы ДНК;
3) определение вторичной структуры молекулы ДНК;
4) определение молекулярной массы молекулы ДНК;
5) прочтение нуклеотидной последовательности.
2. В каком из перечисленных методов участвует белок, связывающий одноцепочечную ДНК (SSB)?
1) рекомбиназно-полимеразная амплификация; +
2) мультилокусное сиквенс-типирование;
3) полимеразная цепная реакция;
4) секвенирование по Сэнгеру;
5) транскрипционная амплификация.
3. В основе секвенирования по Сэнгеру лежит
1) остановка синтеза молекулы ДНК при включении дидезоксирибонуклеозидтрифосфата; +
2) внесение ошибок при синтезе ДНК в случае резкого избытке одного из дезоксирибонуклеозидтрифосфатов;
3) высвобождение пирофосфата при элонгации молекулы ДНК;
4) изменение pH при элонгации молекулы ДНК;
5) химическое расщепление ДНК по определенным азотистым основаниям.
4. Дидезоксирибонуклеозидтрифосфаты с отсутствием 3'-OH группы используются в реакции
1) секвенирования по Сэнгеру; +
2) выделения ДНК;
3) полимеразной цепной реакции;
4) секвенирования на нанопорах;
5) транскрипционной амплификации.
5. Для фермента Cas12a при успешном распознавании мишени характерно включение
1) нуклеазной активности; +
2) активности обратной транскриптазы;
3) активности рекомбиназы;
4) активности цитозин-дезаминазы.
6. Из какого микроорганизма выделена ДНК-полимераза, наиболее часто используемая для проведения ПЦР?
1) экстремальный термофил Thermus aquaticus; +
2) алкалифил Vibrio cholerae;
3) облигатный анаэроб Clostridium difficile;
4) облигатный аэроб Pseudomonas aeruginosa;
5) психрофил Yersinia pestis.
7. Какая из перечисленных технологий лежит в основе метагеномных исследований?
1) Next generation sequencing (NGS); +
2) гель-электрофорез;
3) полимеразная цепная реакция в реальном времени;
4) секвенирование по Сэнгеру.
8. Какая стадия стандартного ПЦР-цикла требует самую высокую температуру?
1) денатурация; +
2) все шаги происходят при одинаковой температуре;
3) отжиг праймеров;
4) элонгация.
9. Какие из перечисленных методов относятся к методам амплификации нуклеиновых кислот?
1) полимеразная цепная реакция; +
2) рекомбиназно-полимеразная амплификация; +
3) транскрипционная амплификация; +
4) мультилокусное сиквенс-типирование;
5) секвенирование по Сэнгеру.
10. Какие методы могут быть использованы для наработки большого количества копий участка ДНК, пригодных для секвенирования по Сэнгеру?
1) молекулярное клонирование; +
2) полимеразная цепная реакция; +
3) денатурация ДНК;
4) элонгация ДНК.
11. Какие шаги обычно входят в один цикл ПЦР?
1) денатурация; +
2) отжиг праймеров; +
3) элонгация; +
4) транскрипция;
5) трансляция.
12. Какое количество флуоресцентных меток используется в одной реакции автоматизированного секвенирования по Сэнгеру?
1) четыре (по одной на каждый тип азотистого основания); +
2) двадцать (по одной на каждую из аминокислот);
3) две (по одной на каждую цепь двойной спирали);
4) одна (на один праймер);
5) шестьдесят четыре (по одной на каждый кодон).
13. Какой из перечисленных методов позволяет осуществлять параллельное прочтение множества длинных фрагментов ДНК без предварительной амплификации?
1) секвенирование на нанопорах; +
2) рекомбиназно-полимеразная амплификация;
3) секвенирование по Сэнгеру;
4) транскрипционная амплификация.
14. Какой из перечисленных ферментов участвует в транскрипционной амплификации?
1) РНК-полимераза; +
2) ДНК-гираза;
3) ДНК-лигаза;
4) щелочная фосфатаза.
15. Какой подход направлен на изучение состава микробного сообщества путем секвенирования множества амплифицированных фрагментов гена 16S рРНК?
1) метатаксономика; +
2) метаболомика;
3) метапротеомика;
4) транскриптомика.
16. Какой способностью должен обладать амплификатор для проведения ПЦР?
1) изменять температуру реакционной смеси по заданной программе; +
2) заменять реакционный буфер после каждого цикла;
3) ионизировать молекулы нуклеиновых кислот;
4) производить детекцию бактериальных и вирусных белков;
5) производить электропорацию бактериальных клеток.
17. Какой фермент играет основную роль в ПЦР?
1) термостабильная ДНК-полимераза; +
2) ДНК-лигаза;
3) ДНК-метилтрансфераза;
4) сайт-специфическая рекомбиназа;
5) эндонуклеаза рестрикции.
18. Какую реакцию способна катализировать обратная транскриптаза?
1) синтеза ДНК на матрице РНК; +
2) синтеза РНК на матрице ДНК;
3) синтеза РНК на матрице белка;
4) синтеза белка на матрице РНК;
5) синтеза случайных последовательностей ДНК.
19. Какую реакцию способна катализировать рекомбиназа UvsX?
1) замещение одной цепочки ДНК в двойной спирали другой цепочкой; +
2) разрушение РНК, находящейся в двойной спирали с ДНК;
3) синтеза РНК на матрице ДНК;
4) синтеза РНК на матрице белка;
5) синтеза случайных последовательностей ДНК.
20. Мультилокусное секвенс-типирование - это молекулярный метод, используемый для
1) эпидемиологического надзора за распространением бактериальных штаммов; +
2) выявления бактериальных патогенов;
3) исследования состава микробных сообществ;
4) определения чувствительности к антибиотикам.
21. Один из праймеров, используемый для транскрипционной амплификации, должен содержать
1) последовательность промотора; +
2) ген антибиотикорезистентности;
3) молекулярный зонд;
4) участок распознавания эндонуклеазы рестрикции.
22. Отличия реакционной смеси для реакции секвенирования по Сэнгеру от реакционной смеси для ПЦР состоят в
1) наличии меченых дидезоксинуклеозидтрифосфатов; +
2) наличии только одного праймера; +
3) отсутствии ферментов;
4) присутствии РНК-полимеразы;
5) присутствии антибиотиков.
23. Получение контигов из перекрывающихся прочтений носит название
1) сборка de novo; +
2) картирование прочтений;
3) поиск вариантов;
4) таксономическая классификация.
24. Праймеры, применяемые в ПЦР, транскрипционно-матричной амплификации и рекомбиназно-полимеразная амплификации - это
1) короткие одноцепочечные молекулы ДНК; +
2) длинные двухцепочечные молекулы ДНК;
3) нуклеозидтрифосфаты;
4) радиоактивные или биотиновые метки;
5) термостабильные ферменты.
25. С какой целью применяются интеркалирующие красители в методах амплификации нуклеиновых кислот?
1) они будут флуоресцировать пропорционально количеству ДНК в пробе; +
2) они обеспечивают разную подвижность двойных спиралей ДНК в зависимости от размера;
3) они придают отрицательный заряд молекулам ДНК;
4) они разрушают молекулы ДНК;
5) они способствуют денатурации двойных спиралей ДНК.
26. Секвенирование ДНК представляет собой
1) определение последовательности нуклеотидов, составляющих молекулу ДНК; +
2) анализ повреждений молекулы ДНК;
3) многократное копирование определенного участка ДНК;
4) определение вторичной структуры молекулы ДНК;
5) определение молекулярной массы молекулы ДНК.
27. Технологии NGS используют для того, чтобы провести
1) параллельное секвенирование множества фрагментов ДНК; +
2) определение спектра масс белков в бактериальной клетке;
3) очистку ДНК от посторонних примесей;
4) параллельное культивирование множества бактериальных штаммов;
5) секвенирование одного длинного фрагмента ДНК.
28. Точным и широко распространенным методом видовой идентификации чистой культуры бактерий является
1) секвенирование гена 16S рРНК; +
2) ПЦР в реальном времени гена ДНК-гиразы;
3) гель-электрофорез ДНК-полимеразы;
4) определение массы бактериальной хромосомы;
5) определение числа копий гена 16S рРНК в хромосоме.
29. Что такое "контиг" в контексте сборки генома?
1) непрерывная последовательность ДНК, собранная из перекрывающихся ридов; +
2) отдельное короткое прочтение как результат работы секвенатора;
3) регион генома, кодирующий белок;
4) фрагмент ДНК, амплифицированный ПЦР.
30. Чтобы осуществлять выявление молекул РНК с помощью ПЦР, необходимо сначала синтезировать на их матрице ДНК. Какой фермент способен осуществлять такую реакцию?
1) обратная транскриптаза; +
2) ДНК-лигаза;
3) ДНК-полимераза;
4) РНК-полимераза;
5) транспозаза.